水是穴盘生产中最重要的因素，因此对水质进行了解非常有必要。劣质水质会破坏土壤结构，组织空气和水的渗透，造成个别离子缺乏。水质在不同地区有很大差异，即使在同一地区，因水源的不同，从一个地方到另一个地方也要发生变化，今天介绍一种应用肥料调节水质的方法。

　　　水的PH值并不能直接影响生长基质上PH值，但水的碱度则直接影响生长基质和植物的营养吸收有影响。对穴盘生产而言，应该保持水的碱度为60～80mg/L。

中等碱度的水质（100～200 mg/L）可用酸性肥料调节，其中有20-20-20、20-10-20。用酸性肥料控制碱度的困难在于既需要持续使用酸性肥料以降低碱度，又要控制NH₄⁺，以防止穴盘苗徒长。因此，酸性肥使用量应与穴盘苗的种类及控制穴盘苗的生长相结合。穴盘苗的生长有赖于肥水的控制，对穴盘苗而言，含高浓度NH₄⁺的肥料促进茎叶生长，对根的生长不利，而且导致植株徒长和柔软。因此，这种高NH₄⁺的酸性肥料应根据作物种类和需要与其他肥料搭配使用。

使用含钙、镁的碱性肥料，对钙镁含量较低的低碱度水非常有益，可增加其缓冲能力。但需注意肥料中含钙以增加基质PH。使用低碱度水是，一定要注意使用肥料类型及使用量，确保不会造成基质PH值变化太快。

若水中含有中等或较高的硼，要使用不含硼的肥料，硼的毒性有时也会成为一个问题，多数肥料都加有一定量的硼以补充水中含硼量的不足。